北河以北

文献管理的 3.0 时代

文/宋春林

最近改用 Papers 3 作为文献管理软件,我的文献管理进入了 3.0 时代。先交待一下背景,1.0 时代是 NoteExpress,当时本科所在学校给买了正版,写毕业论文的时候参考文献比较多,顺手就用了几个月。2.0 时代即读研究生以后用 EndNote 管理文献信息,使用的原因同样是中科院给买了正版,主要作用还是结合 Web of Science 收集文献,然后写论文的时候插入文献信息。对于 PDF 文献则按照一定规则命名放在硬盘,也就是说文献信息和文献本身是分离的,我之前的博文有详述。这种方式固然很好,但是自从我换了 Mac 之后就一直希望减少打开 Windows 虚拟机的次数,尽量把工作转移到 OS X 下,而 EndNote 结合 Word 写论文是我少数必须打开 Windows 的原因之一(另一个是只有 Windows 平台的 ArcGIS)。去年发布的 Office 2016 for Mac 易用性得到了很大的提高,唯一的问题就是文献管理软件了。试过 Mac 上的 Endnote,但是中科院只给买了 X6 的正版,功能极其简陋。在试过 Zotero,Mendeley 和 Papers 3,决定用 Papers 3。转换成本并不高,EndNote 导出的文献信息全部导入 Papers 3,本地的 PDF 文件根据分组拖进 Papers 3 再删除重复的文献信息即可。

其实 Mendeley 和 Papers 3 是不相伯仲、各有千秋的,但是 Papers 3 颜值更高,好看就是生产力。下面我从搞科研的基本工作流程来说明 Papers 3 好在哪里。

第一步一般是根据关键词查文献、搜集文献,这一切都可以在 Papers 3 内置的搜索引擎里完成,这个搜索引擎整合了大部分文献数据库,支持各种字段的搜索。文献信息可以一键导入,如果此时你在学校内网环境,甚至可以直接下载 PDF 文件。下载的 PDF 文件可以设置自己喜欢的格式自动重新命名,比如我就是“作者-刊名-卷-页码-年份”的命名格式,万一需要找到特定的PDF文件(其实一般不需要)就可以很方便。假如已经有 PDF 文献了但是 Papers 3 里没有文献信息,只需要把 PDF 文件拖入 Papers 3 即可,它会自动识别文献信息,除了早期的一些图片版 PDF,识别率还不错。就算识别不出来或者识别不全,还可以通过 Match 功能利用内置搜索引擎补全文献信息。如果喜欢在浏览器直接在 Google、Google Scholar或者各个数据库搜索,也可以通过浏览器 Bookmarklet 导入文献信息。我个人有时会浏览专业杂志主页,看的感兴趣的文献,用 Chrome 插件一键加入到 Papers 3 的 reading list 里面以备不时之需。

第二步是整理和阅读文献。Papers 3 通过收藏集(Collections)来归类不同的文献信息,除此之外它还支持智能收藏集(Smart Collection),设置一定的规则,导入的文献信息就自动进入到这个收藏集里。Paper 3 内置了功能足够的 PDF 阅读器,标注、做笔记、文字标签、颜色标签一应俱全。不同属性的排序和标记基本上可以迅速定位到想要找的文献信息。不仅如此,Papers 3 支持 PDF 全文和笔记、标注的搜索,这样在写文章的时候想起某句话、某个观点但就是想不起哪篇文献的时候就很有用了,一搜便知。

做完实验得到数据,第三步就是写文章引用文献了。不同于 EndNote 或者 Mendeley 用 Word 插件的方式,在写作的时候通过 Papers 3 唤起插入文献的小窗口,简单的搜索就可以快速插入想要引用的文献。引文格式当然是可以修改的,支持大多数主流期刊样式。相比 EndNote 插入引文的方式,我觉得这种方式更自然。

除了以上介绍的,Papers 还支持用 Dropbox 以及局域网同步(局域网同步太赞!),这样结合 iOS 客户端,在移动设备上也可以愉快的看文献了,换了电脑同样没有问题。其他特色功能感兴趣的自己去探索吧,免费用一个月,一个月后79欧元,但是如果是学生的话可以申请到49欧元的优惠价,一个授权支持三台机器。  

Papers 3 是我用过的最好的文献管理软件,结合 Word 2016 for Mac(虽然流畅度相比 Windows 下还是差了一点),在 OS X 上写文章可以说是一种享受。

对了,如果有人想跟我合买 Papers 3 的正版授权,请充分试用、慎重考虑后与我联系(scl(AT)songchunlin.net),我是 49 欧元买的,还可以授权两台机器(100元每台),此信息在此处即说明此信息还有效。(已结束)

Comments

Dong: 竟然又碰到一个做科研的,幸会幸会。

themebetter: 文献,科研,高大上。

Elizen: 我最发愁的不是文献管理什么的,我用的也不多,而是个人资料的管理…文档类型多,个人笔记多,Evernote 越用越不爽的感觉。

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分类 学术科研  标签 文献管理  Mac